该仲裁委员会设立了以下若干内部组织机构：
1．委员和委员会议。仲裁委员会委员由仲裁委员会聘请经济贸易、法律等方面的专家人士担任，每届任期3年。
仲裁委员会委员通过仲裁委员会委员会议来行使其职权，委员会议每年召开一次，如有需要，也可以召开临时会议。仲裁委员会每次委员会议，须有半数以上的委员出席方能进行，会议由委员会议主席或者主席授权的副主席主持召开。会议形成决议时，须由半数以上的委员通过才有效。
仲裁委员会委员会议的主要任务是：审议、通过仲裁委员会秘书长提出的年度工作报告；审议、通过关于制定和修改仲裁委员会仲裁规则的草案，并报中国国际贸易促进委员会核准通过；制订和修仲裁委员会的章程；讨论有关仲裁委员会的工作方式、政策等重要事项并形成相应的决议。
2．主任会议。仲裁委员会由主任1人、副主任2人至4人和委员7人至11人组成。仲裁委员会的主任、副主任和委员由法律、经济贸易专家和有实际经验的人员担任。
仲裁委员会和仲裁委员会分会的主任、副主任和秘书长分别组成仲裁委员会和仲裁委员会分会的主任会议，在仲裁委员会议闭会期间，分别负责仲裁委员会和仲裁委员会分会的工作。
3．仲裁咨询委员会。在仲裁委员会内部设立专家咨询委员会，由仲裁委员会主任会议决定聘请5名至15名专家组成，该专家咨询委员会设主任委员人，由仲裁委员会副主任兼任。
4．秘书局（处）。仲裁委员会设秘书局，仲裁委员会分会设秘书处，分别负责仲裁委员会和分会的日常事务，包括受理案件的登记管理，仲裁费用的收取，仲裁程序的管理，非仲裁庭调解案件的调解等。
5．秘书长会议。
6．仲裁研究所。
